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根据《职工税收优惠》的规定，北京市职工在年度收入中所获得的交通补助，不计入工资收入，不予缴纳个人所得税，但需要扣除一定的部分，由北京市人民政府根据市内物价水平和职工补贴金额来决定。这一扣除部分，将由企业对职工发放的交通补贴中，扣除后发放职工。 与此同时，北京市在《职工税收优惠》中也进行了相关规定，即改变城镇职工个人所得税最高起征点，将3000元提高至5000元，以此中和部分职工收入低于3000元的补贴扣除。