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是的，总分公司可以享受季度收入小于45万免交增值税的政策。根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第五十六条的规定，企业进行一般纳税人税收调整的，季度收入在45万元以下的企业，其增值税发生出口劳务经营收入的，可以采用季度累计的方式免征增值税。由于总分公司的季度收入是40万元和30万元，所以都可以享受季度收入小于45万元免交增值税的政策。当然，具体情况还需要根据当地税务机关的规定和要求进行实施。