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小规模纳税人普票免税的金额应该记入营业外收入。按国家税务总局《企业所得税纳税申报纠纷处理规定》第三十七条规定，小规模纳税人普通发票免税的金额应记入营业外收入；根据有关法律法规的规定，小规模纳税人普通发票免税的金额应以1%的税率记入收入，即免征收1%的企业所得税；或者，以便纳税人有效控制企业所得税，可以按照3%的税率记入收入，即免征收3%的企业所得税。