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小规模纳税人在交纳水利建设基金时，是不需要缴税的。 水利建设基金有针对小规模纳税人单独设定的标准，即免收水利建设基金税。根据相关法律法规，小规模纳税人在当年内发生的本月营业收入的总额不超过45万元的，免收水利建设基金税。因此，小规模纳税人在交纳水利建设基金时，实际上是不需要缴税的。 同时，为了支持小规模纳税人健全纳税义务，中央出台了《关于小规模纳税人实施差别征税政策暂行办法的通知》，明确提出：小规模纳税人可以适当降低附加税的税率，免征增值税节税以及另行确定的城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加和城市维护建设税；同时，对小规模纳税人按一定标准免征水利建设基金税。由此可见，小规模纳税人在交纳水利建设基金时，是不需要缴税的。