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国有土地租赁合同转让应纳税款主要包括增值税，即房地产相关税种，具体如下： （1）土地使用税：按照土地所处地区规定的标准来征收； （2）印花税：如果租赁合同金额在50万元以上，则应收取0.05%的印花税； （3）增值税：由买卖双方自行计算，根据租赁合同中约定的土地价格及印花税收入，再参照国家相关规定来计算； （4）个人所得税：如果卖方为个人，则应按照有关规定来缴纳； （5）流转税：如果租赁合同金额超过100万元，则应按照国家规定，另外收取2%的流转税。 拓展知识：另外，对于国有土地租赁合同转让，国家还实行了多种税收优惠政策，可以减免部分税费，但是国家的规定比较复杂，要根据不同地区的不同情况来缴纳税款。