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超过45万小规模增值税纳税人应当按照如下步骤来申报增值税： 1、获得增值税发票资格。低于45万元的小规模纳税人可以根据《税收征收管理法》第四十三条所述的情况，申请获得增值税发票资格； 2、在办理税收登记表的同时，按照国家规定的标准，申请开具增值税发票； 3、增值税纳税人按照月度、季度、半年度和年度等不同的账务期间，按照税收征收管理机关规定的税率核定增值税销售额，计算自行申报的应纳增值税额； 4、经核定的增值税额，增值税纳税人需要在规定时间内按照税收征收管理机关规定的方式申报缴纳； 5、每月应纳增值税额和申报的应纳增值税额相比，如果有减少，增值税纳税人应当在规定的时间内，提交相应的补充申报资料，以便税务机关核实和登记； 6、如果增值税纳税人没有按时缴纳增值税，税收征收管理机关将对其进行处罚。