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一般情况下，公司可以在发放工资时，对员工的应纳税收入进行税前扣除。根据我国《个人所得税法》的规定，职工的应纳税收入可以在收入发放前，经过扣除税前工资扣除项之后，计算税金，并进行个人所得税的缴纳。一般来说，扣除项包括：住房公积金、子女教育、继续教育、住房租金、赡养老人等五项，对应的有关发放扣除项以及标准有不同的要求，依据具体情况进行扣除。 拓展知识：除了税前工资扣除，还有一项个税改革政策叫做“专项附加扣除”，它是指个人可以在申报纳税时，将一部分支出的费用视为专项扣除，从而减少纳税额度。具体来说，可以扣除的费用有：子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金等。