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老师您好，有没有关于这方面的文件呢

根据《国家税务总局关于加强增值税征收管理若干问题的通知》的规定：纳税人购进货物或应税劳务，支付运输费用，所支付款项的单位，必须与开具抵扣凭证的销货单位、提供劳务的单位一致，才能够申报抵扣进项税额，否则不予抵扣。根据上述规定，开票方应为销货单位、提供劳务单位或是提供服务单位；收款人应为开票人。因此由单位直接开票给分公司，形式符合三流一致原则，合同签订方式只要有三方协议或者授权委托书等就可以。