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从财务处理的角度来看，首先你需要确认合同中是否有规定关于这些预付款的相关内容，如果有，就要根据合同来处理，如果没有，则可以按照一般原则来处理。基本上，你可以将100万支付作为物资采购成本支出，在科目上新建一个科目“应付账款-预付款”，将支付的100万作为期初余额登入该科目，然后将200万的货款明细到该科目，算出应付账款余额，在购货时登入“应付账款”科目即可。另外，你还可以将100万支付的预付款作为供应商的预付款，在科目上新建一个科目“应付账款-供应商预付款”，将支付的100万作为期初余额登入该科目，当供应商开具发票时，按照预付款登入“应付账款”科目即可。