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为什么税局说有研发费用不属于农业行业，要改为制造业？

你好； 要看你业务是涉及哪些哈； 根据《财政部国家税务总局科技部关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》（财税〔2015〕119号）规定，本通知适用于会计核算健全、实行查账征收并能够准确归集研发费用的居民企业。不适用税前加计扣除政策的行业，一是烟草制造业；二是住宿和餐饮业；三是批发和零售业；四是房地产业；五是租赁和商务服务业；六是娱乐业；七是财政部和国家税务总局规定的其他行业。其他行业均可以。 

行业：其他农业。可以吗？

是的；明文里面没有说不允许这个的 ；除非你地方不允许；  因为本身农业是免税的； 就不应该加计扣除的