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一般纳税人从小规模纳税人购进的农产品，分为两种情况： 1.小规模纳税人销售的农产品属于自产自销的，小规模纳税人可以按规定开具自产自销农业初级产品免征增值税发票（普通发票），一般纳税人在取得自产自销农产品免税发票后，可以按照如下公式计算抵扣进项税额：可抵扣的进项税额=自产自销农产品销售发票金额×9%，如果是用于深加工的，还可以加计抵扣1%。 2.小规模纳税人销售的农产品不属于自产自销的，但是按照税法规定开具了征收率为3%的增值税专用发票的，一般纳税人在取得自产自销农产品免税发票后，可以按照如下公式计算抵扣进项税额：可抵扣的进项税额=农产品销售增值税专用发票不含税金额×9%，如果是用于深加工的，还可以加计抵扣1%。小规模纳税人销售的农产品不属于自产自销的，如果开具的增值税专用发票是征收率1%的，只能按照发票注明的税额进行抵扣；如果开具的是普通发票，是不得抵扣进项税额的。