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航空运输电子客票行程单可以作为报销凭证使用，并可以计算抵扣进项税。具体计算方式为：可抵扣进项税额=（票价+燃油附加费）÷（1+9%）×9%。其中，燃油附加费也需要纳入抵扣范围。 请注意，抵扣进项税额需要满足一些前提条件，例如纳税人购进国内旅客运输服务，其进项税额允许从销项税额中抵扣。对于纳税人未取得增值税专用发票的，暂按照以下规定确定进项税额：取得增值税电子普通发票的，为发票上注明的税额；取得注明旅客身份信息的航空运输电子客票行程单的，按照上述公式计算进项税额。