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“企业开具发票收入大于所得税申报收入”的意思是，企业在税务系统中开具发票所反映的销售收入数额，超过了企业在所得税申报中所申报的收入数额。 税务机关进行数据比对的方式通常如下： 1.发票数据：通过增值税发票管理系统获取企业开具的增值税发票信息，包括发票金额、开票日期、购买方和销售方等。 2.所得税申报数据：从企业提交的所得税申报表中获取申报的收入数据。 3.数据整合与分析：将上述两类数据进行整合和比对，筛选出发票收入大于所得税申报收入的企业。 例如，企业在某一期间开具的发票金额总计为 100 万元，但在所得税申报中申报的收入仅为 80 万元，就会触发这种风险提示。 出现这种差异可能的原因包括： 1.申报错误：企业在申报所得税时可能漏报或误报了部分收入。 2.收入确认时间差异：发票开具时间和所得税上收入确认的时间可能不同。 3.存在未入账的收入：部分开具发票的收入未在财务账目中正确记录和申报。 企业收到此类风险提示后，应认真核实差异原因，并按照税务机关的要求进行说明和整改