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亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：
D选项不正确的原因在于，尽管甲公司持有40%的股份，而其母公司持有11%的股份，但这并不意味着甲公司能够控制该被投资单位。控制通常是指能够对被投资单位的财务和经营政策施加决定性影响。在公司治理中，母公司和子公司是两个独立的法律实体，子公司持有的股份不能简单地与母公司持有的股份相加来判断控制权。

即使甲公司和其母公司的股份合计超过50%，但这种控制权的判断还需要考虑其他因素，例如是否存在其他大股东、甲公司和其母公司之间的关系、以及甲公司是否能够实际影响或决定被投资单位的财务和经营决策等。如果甲公司不能通过其持股比例直接或间接地影响被投资单位的决策，那么它就不能被认为控制该被投资单位。

在选项A中，甲公司直接和间接（通过子公司丙）持有的股份合计超过50%，因此可以认为甲公司控制了该被投资单位。选项B和E中，甲公司虽然持股比例不超过50%，但由于其他条件（如受托代管或有权决定财务经营政策），甲公司可以被认为拥有控制权。而在选项D中，没有提供足够的信息来证明甲公司能够控制该被投资单位，仅仅持有股份的比例并不足以证明控制权。因此，D选项不正确。
祝您学习愉快！