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亲爱的学员，您好！很高兴能为您提供帮助，您的问题答复如下：
在租赁合同中，当租赁条款发生变更时，承租人需要重新评估租赁负债和使用权资产。根据国际财务报告准则（IFRS16）或类似的会计准则，当租赁合同的现金流量发生变更时，承租人需要使用变更日的增量借款利率来重新计算租赁负债。

选择变更后的增量借款利率的原因包括：

1.**反映当前市场条件**：增量借款利率是承租人在变更日能够获得的借款利率，反映了当前市场的借款成本。使用变更日的利率可以更准确地反映市场条件的变化。

2.**准确计量租赁负债**：租赁负债的现值计算需要使用一个折现率。变更后的增量借款利率能够更准确地计量变更后租赁负债的现值。

3.**符合会计准则要求**：会计准则要求在租赁合同变更时，使用变更日的增量借款利率来重新评估租赁负债和使用权资产，以确保财务报表的准确性和一致性。

在题目中，甲公司在第2年年初与乙公司协商变更租赁合同，租金从每年40万元调整为50万元。由于租赁内含利率无法确定，因此需要使用第2年年初的增量借款利率7%来重新计算租赁负债和使用权资产的调整金额。
祝您学习愉快！