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在所得税和增值税等一些税收核算的方法不同。. 1、在所得税方面不同。个体工商户需要缴纳的是个人所得税，而有限公司缴纳的是企业所得税。个体工商户与个人核算个人所得税的方法并不同，个体工商户使用的是五级超额累进税率，不超过15000元的，税率为5%，超过15000元至30000元的部分，税率为10%，超过30000元至60000元的部分，税率为20%，超过60000元至100000元的部分，税率为30%，超过100000元的部分，税率为35% 2、个体工商户一般为小规模纳税人，而有限责任公司一般为一般纳税人，所以在核算增值税方面也不同。一般纳税人的增值税实行抵扣制度，用的是进项税抵扣的原则，税率是13%，小规模纳税人采用简单核算法，一般税率为3%